Viện An ninh phi truyền thống tập trung nghiên cứu , đào tạo, bồi dưỡng ngắn hạn về kỹ năng, kiến thức mới về quản trị an ninh phi truyền thống cho các bộ, ngành, cơ quan, đơn vị, doanh nghiệp nhà nước và tư nhân trên các lĩnh vực: Quản trị an ninh xã hội, quản trị an ninh gia đình, quản trị an ninh kinh tế, quản trị an ninh y tế, quản trị an ninh tài nguyên môi trường, quản trị an ninh du lịch;
Viện An ninh phi truyền thống tập trung nghiên cứu, đào tạo, bồi dưỡng ngắn hạn về kỹ năng, kiến thức mới về quản trị an toàn giao thông, quản trị an ninh đô thị, quản trị an ninh mạng, quản trị an ninh biển, quản trị an ninh biên giới, quản trị bưu chính viễn thông, quản trị an ninh hàng không, quản trị an ninh trường học, quản trị an ninh báo chí – truyền thông, quản trị an ninh ngoại giao, quản trị an ninh quân sự, quản trị an ninh tôn giáo, quản trị phòng chống tội phạm, quản trị phòng chống thiên tai,…